Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms