Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms