Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms