Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms