Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms