Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP13Q86W25 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms