Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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IRF4Q15306 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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IRF4Q15306 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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