Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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COL19A1Q14993 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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