Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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