Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx3P81067 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms