Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTPAP49638 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTPAP49638 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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