Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPFP49454 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPFP49454 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms