Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms