Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APODP05090 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APODP05090 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APODP05090 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms