Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms