Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms