Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms