Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms