Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PREPP48147 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PREPP48147 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PREPP48147 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PREPP48147 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PREPP48147 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PREPP48147 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PREPP48147 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PREPP48147 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PREPP48147 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PREPP48147 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PREPP48147 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PREPP48147 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PREPP48147 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PREPP48147 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PREPP48147 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PREPP48147 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PREPP48147 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PREPP48147 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PREPP48147 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PREPP48147 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms