Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SdhdQ9CXV1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms