Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms