Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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