Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN17P56750 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN17P56750 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN17P56750 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CLDN17P56750 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN17P56750 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN17P56750 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN17P56750 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN17P56750 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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