Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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