Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms