Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms