Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETM2Q2VYF4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETM2Q2VYF4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETM2Q2VYF4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETM2Q2VYF4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETM2Q2VYF4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETM2Q2VYF4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETM2Q2VYF4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETM2Q2VYF4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETM2Q2VYF4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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