Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RdxP26043 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RdxP26043 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RdxP26043 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RdxP26043 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RdxP26043 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RdxP26043 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RdxP26043 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RdxP26043 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RdxP26043 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RdxP26043 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RdxP26043 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RdxP26043 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RdxP26043 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RdxP26043 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RdxP26043 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RdxP26043 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RdxP26043 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RdxP26043 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms