Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms