Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif28pD3YXS5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms