Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1BQ9NZR2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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