Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smurf1Q9CUN6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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