Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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