Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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