Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms