Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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