Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms