Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb7P09024 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms