Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP2O95045 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP2O95045 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms