Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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