Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms