Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp27Q8CEG8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp27Q8CEG8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp27Q8CEG8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp27Q8CEG8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp27Q8CEG8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp27Q8CEG8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp27Q8CEG8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp27Q8CEG8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp27Q8CEG8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp27Q8CEG8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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