Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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