Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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