Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax5Q02650 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax5Q02650 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms