Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbp10Q000W5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms