Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FmodP50608 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FmodP50608 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms