Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms