Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms