Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm21411J3KMS0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm21411J3KMS0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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